Kas ir peptīdi? Peptīdi ir īsas aminoskābju ķēdes starp klasiskajām aktīvajām vielām un antivielām: pietiekami lielas specifiskai bioloģiskai aktivitātei, pietiekami mazas reproducējamai sintēzei.
20 kanoniskās aminoskābes veido jebkuras dabiskas peptīdu sekvences vārdu krājumu. Katrai ir kopīgs pamatkarkass, un tā atšķiras ar savu sānu ķēdi.
Nestandarta būvelementi, piemēram, D-aminoskābes, Hyp vai Aib, paplašina stabilitāti, pusperiodu un konformācijas kontroli.
Veido hidrofobo kodolu; Pro pārtrauc α-spirāles un stabilizē β-pagriezienus.
π-sakraušanās un UV absorbcija pie 280 nm, HPLC detekcijas pamats.
Ūdeņraža saites; Cys nodrošina disulfīda tiltus.
Sāļu tilti un no pH atkarīga protonēšana.
Stabilitāte, pusperiods un membrānas caurlaidība.
Peptīdu saite veidojas, kondensējoties α-COOH grupai ar nākamās aminoskābes α-NH₂ grupu. Planārais amīda pamatkarkass nosaka konformāciju.
Φ un Ψ divplakņu leņķi nosaka sekundāro struktūru. Ramachandrana diagramma vizualizē atļautās kombinācijas.
Aizsargā galus no eksopeptidāžu noārdīšanas.
Proteāzes neatzīst D-konfigurāciju šķelšanās vietās.
Ciklizācija no gala līdz galam vai disulfīda tilti stabilizē struktūru.
Taukskābju enkuri pagarina pusperiodu ar seruma albumīna starpniecību.
Cietfāzes peptīdu sintēze (SPPS) piestiprina augošo ķēdi pie polimēra sveķiem. Katrā ciklā: aizsardzības noņemšana un nākamās Fmoc-aminoskābes savienošana.
Pirmā aminoskābe uz Wang vai Rink amīda sveķiem. Ielādes blīvums 0,2–0,8 mmol/g.
Fmoc grupas atdalīšana ar piperidīnu DMF vidē.
Aktivizēšana ar HBTU/HATU vai DIC/Oxyma.
Šķelšana ar TFA no sveķiem un sānu ķēžu aizsarggrupu noņemšana.
Cietfāze, sekvence aug uz sveķiem.
Gramu līdz kilogramu mērogs.
Gredzena noslēgšana stabilitātei.
Pret proteāzēm noturīga konfigurācija.
Albumīna saistīšanās un pusperioda pagarināšana.
Zāļu-albumīna konjugāti ar Cys-maleimīdu.
RP-HPLC ar C18 fāzi tīrībai.
Liofilizēts aizsarggāzē.
Hromatogrāfija, masspektrometrija, smago metālu kontrole un mikrobioloģiskā drošība sniedz pilnīgu priekšstatu par partiju.
Apgrieztās fāzes metode ar UV detekciju tīrībai un identitātei.
Molekulmasa un fragmentācija.
Smagie metāli ppb līmenī.
Mikrobioloģiskā drošība saskaņā ar USP.