Peptiidid on lühikesed aminohappeahelad klassikaliste toimeainete ja antikehade vahel: piisavalt suured spetsiifilise bioloogilise aktiivsuse jaoks ja piisavalt väikesed reprodutseeritava sünteesi jaoks.
20 kanoonilist aminohapet moodustab iga loodusliku peptiidijärjestuse sõnavara. Igal neist on ühine selgroog ja igaüks erineb kõrvalahela poolest.
Mittestandardsed ehituskivid, nagu D-aminohapped, Hyp või Aib, laiendavad stabiilsust, poolestusaega ja konformatsioonikontrolli.
Moodustavad hüdrofoobse tuuma; Pro katkestab α-heelikseid ja stabiliseerib β-pöördeid.
π-stäkkimine ja UV-absorbtsioon 280 nm juures, HPLC-detektsiooni alus.
Vesiniksidemed; Cys võimaldab disulfiidsildu.
Soolasillad ja pH-st sõltuv prootoniseerimine.
Stabiilsus, poolestusaeg ja membraaniläbilaskvus.
Peptiidside tekib α-COOH-rühma kondenseerumisel järgmise aminohappe α-NH₂-rühmaga. Planaarne amiidselgroog määrab konformatsiooni.
Φ- ja Ψ-diedrinurgad määravad sekundaarstruktuuri. Ramachandrani diagramm visualiseerib lubatud kombinatsioonid.
Kaitseb terminaale eksopeptidaaside lagundamise eest.
Proteaasid ei tunne lõikamiskohtades ära D-konfiguratsiooni.
Head-to-tail-ühendus või disulfiidsillad stabiliseerivad struktuuri.
Rasvhappeankrud pikendavad poolestusaega seerumialbumiini kaudu.
Tahke faasi peptiidisüntees (SPPS) kinnitab kasvava ahela polümeervaigule. Tsükli kohta: kaitse eemaldamine ja järgmise Fmoc-aminohappe sidumine.
Esimene aminohape Wang- või Rink-amiidvaigul. Laadimistihedus 0,2–0,8 mmol/g.
Fmoc-rühma eemaldamine piperidiiniga DMF-is.
Aktiveerimine HBTU/HATU või DIC/Oxyma abil.
TFA-ga lõhustamine vaigult ja kõrvalahela kaitsegruppide eemaldamine.
Tahke faas, järjestus kasvab vaigul.
Grammi- kuni kilogrammimastaap.
Rõnga sulgemine stabiilsuse jaoks.
Proteaasiresistentne konfiguratsioon.
Albumiiniga seondumine ja poolestusaja pikenemine.
Ravimialbumiini konjugaadid Cys-maleimiidi kaudu.
RP-HPLC C18-l puhtuse määramiseks.
Külmkuivatatud kaitsegaasi all.
Kromatograafia, massispektromeetria, raskmetallide kontroll ja mikrobioloogiline ohutus annavad partiist tervikliku pildi.
Pöördfaas UV-detekteerimisega puhtuse ja identiteedi määramiseks.
Molekulmass ja fragmenteerimine.
Raskmetallid ppb-tasemel.
Mikrobioloogiline ohutus USP järgi.