Ova stranica objašnjava što su peptidi: kratki lanci aminokiselina između klasičnih djelatnih tvari i antitijela, dovoljno veliki za specifičnu biološku aktivnost i dovoljno mali za ponovljivu sintezu.
20 kanonskih aminokiselina čini vokabular svake prirodne peptidne sekvence. Svaka ima zajedničku okosnicu, a razlikuje se po svom bočnom ogranku.
Nestandardne gradivne jedinice poput D-aminokiselina, Hyp ili Aib proširuju stabilnost, vrijeme poluživota i kontrolu konformacije.
Tvore hidrofobnu jezgru; Pro prekida α-uzvojnice i stabilizira β-okrete.
π-slaganje i UV apsorpcija pri 280 nm, osnova HPLC detekcije.
Vodikove veze; Cys omogućuje disulfidne mostove.
Solni mostovi i pH-ovisna protonacija.
Stabilnost, vrijeme poluživota i membranska permeabilnost.
Peptidna veza nastaje kondenzacijom α-COOH skupine s α-NH₂ skupinom sljedeće aminokiseline. Planarna amidna okosnica određuje konformaciju.
Diedarski kutovi Φ i Ψ određuju sekundarnu strukturu. Ramachandranov dijagram prikazuje dopuštene kombinacije.
Štiti krajeve od razgradnje egzopeptidazama.
Proteaze ne prepoznaju D-konfiguraciju na mjestima cijepanja.
Head-to-tail ili disulfidni mostovi stabiliziraju strukturu.
Ankori masnih kiselina produljuju vrijeme poluživota putem serumskog albumina.
Sinteza peptida na čvrstoj fazi (SPPS) pričvršćuje rastući lanac na polimernu smolu. U svakom ciklusu: uklanjanje zaštite i sprezanje sljedeće Fmoc-aminokiseline.
Prva aminokiselina na Wang ili Rink-amidnoj smoli. Gustoća opterećenja 0,2–0,8 mmol/g.
Uklanjanje Fmoc-zaštitne skupine piperidinom u DMF-u.
Aktivacija s HBTU/HATU ili DIC/Oxyma.
Cijepanje TFA s nosača i uklanjanje zaštitnih skupina bočnih lanaca.
Čvrsta faza, sekvenca raste na smoli.
Mjerilo od grama do kilograma.
Zatvaranje prstena radi stabilnosti.
Konfiguracija otporna na proteaze.
Vezanje na albumin i produljenje vremena poluživota.
Konjugati djelatne tvari s albuminom preko Cys-maleimida.
RP-HPLC na C18 za čistoću.
Liofilizirano pod zaštitnim plinom.
Kromatografija, masena spektrometrija, kontrola teških metala i mikrobiološka sigurnost daju cjelovitu sliku šarže.
Reverzna faza s UV detekcijom za čistoću i identitet.
Molekulska masa i fragmentacija.
Teški metali na razini ppb.
Mikrobiološka sigurnost prema USP.