Peptidy sú krátke reťazce aminokyselín medzi klasickými účinnými látkami a protilátkami: dostatočne veľké na špecifickú biologickú aktivitu, dostatočne malé na reprodukovateľnú syntézu.
20 kanonických aminokyselín tvorí slovník každej prirodzenej peptidovej sekvencie. Každá má spoločnú kostru a líši sa bočným reťazcom.
Neštandardné stavebné prvky, ako D-aminokyseliny, Hyp alebo Aib, rozširujú stabilitu, polčas rozpadu a konformáčnú kontrolu.
Tvoria hydrofóbne jadro; Pro narúša α-helixy a stabilizuje β-otočky.
π-stacking a absorpcia UV pri 280 nm, základ detekcie HPLC.
Vodíkové väzby; Cys umožňuje disulfidové mostíky.
Soľné mostíky a protonizácia závislá od pH.
Stabilita, polčas rozpadu a permeabilita membrány.
Peptidová väzba vzniká kondenzáciou α-COOH skupiny s α-NH₂ skupinou nasledujúcej aminokyseliny. Planárna amidová kostra určuje konformáciu.
Dihedrálne uhly Φ a Ψ určujú sekundárnu štruktúru. Ramachandranov diagram vizualizuje povolené kombinácie.
Chráni konce peptidu pred odbúravaním exopeptidázami.
Proteázy nerozpoznávajú D-konfiguráciu v miestach štiepenia.
Prepojenie hlava-chvost alebo disulfidové mostíky stabilizujú štruktúru.
Kotvy mastných kyselín predlžujú polčas rozpadu prostredníctvom sérového albumínu.
Syntéza peptidov na pevnej fáze (SPPS) ukotvuje rastúci reťazec na polymérnej živici. V každom cykle: odchránenie a naviazanie ďalšej Fmoc-aminokyseliny.
Prvá aminokyselina na Wangovej alebo Rink-amidovej živici. Hustota naviazania 0,2–0,8 mmol/g.
Odstránenie Fmoc piperidínom v DMF.
Aktivácia pomocou HBTU/HATU alebo DIC/Oxyma.
Štiepenie pomocou TFA z živice a odstránenie ochranných skupín bočných reťazcov.
Pevná fáza, sekvencia rastie na živici.
Rozsah od gramov po kilogramy.
Uzavretie kruhu pre stabilitu.
Konfigurácia odolná voči proteázam.
Väzba na albumín a predĺženie polčasu rozpadu.
Konjugáty liečiva s albumínom prostredníctvom Cys-Maleimidu.
RP-HPLC na C18 pre stanovenie čistoty.
Lyofilizované v ochrannej atmosfére.
Chromatografia, hmotnostná spektrometria, kontrola ťažkých kovov a mikrobiologická bezpečnosť poskytujú kompletný obraz šarže.
Reverzná fáza s UV detekciou pre čistotu a identitu.
Molekulová hmotnosť a fragmentácia.
Ťažké kovy na úrovni ppb.
Mikrobiologická bezpečnosť podľa USP.