Peptidi so kratke verige aminokislin med klasičnimi učinkovinami in protitelesi: dovolj veliki za specifično biološko aktivnost, dovolj majhni za ponovljivo sintezo.
20 kanoničnih aminokislin tvori besednjak vsake naravne peptidne sekvence. Vsaka ima skupno ogrodje in se razlikuje po svoji stranski verigi.
Nestandardni gradniki, kot so D-aminokisline, Hyp ali Aib, povečujejo stabilnost, razpolovni čas in nadzor konformacije.
Tvorijo hidrofobno jedro; Pro prekinja α-vijačnice in stabilizira β-obrate.
π-stacking in UV-absorpcija pri 280 nm, osnova detekcije s HPLC.
Vodikove vezi; Cys omogoča disulfidne mostove.
Solni mostovi in protonacija, odvisna od pH.
Stabilnost, razpolovni čas in membranska prepustnost.
Peptidna vez nastane s kondenzacijo skupine α-COOH s skupino α-NH₂ naslednje aminokisline. Planarno amidno ogrodje določa konformacijo.
Diedrska kota Φ in Ψ določata sekundarno strukturo. Ramachandranov diagram prikazuje dovoljene kombinacije.
Ščiti konce pred razgradnjo z eksopeptidazami.
Proteaze ne prepoznajo D-konfiguracije na mestih cepitve.
Povezava glava-rep ali disulfidne vezi stabilizirajo strukturo.
Sidra maščobnih kislin podaljšajo razpolovni čas prek serumskega albumina.
Sinteza peptidov na trdni fazi (SPPS) zasidra rastočo verigo na polimerno smolo. V vsakem ciklu: odstranitev zaščite in spajanje naslednje Fmoc-aminokisline.
Prva aminokislina na Wang- ali Rink-amidni smoli. Gostota nalaganja 0,2–0,8 mmol/g.
Odcepitev Fmoc s piperidinom v DMF.
Aktivacija s HBTU/HATU ali DIC/Oxyma.
Odstranitev zaščitnih skupin stranskih verig in odcepitev od smole s TFA.
Trdna faza, zaporedje raste na smoli.
V merilu od gramov do kilogramov.
Zapiranje obroča za stabilnost.
Konfiguracija, odporna proti proteazam.
Vezava na albumin in podaljšanje razpolovnega časa.
Konjugati učinkovin z albuminom prek Cys-maleimida.
RP-HPLC na C18 za čistost.
Liofilizirano v zaščitnem plinu.
Kromatografija, masna spektrometrija, nadzor težkih kovin in mikrobiološka varnost dajejo popolno sliko serije.
Reverzna faza z UV-detekcijo za čistost in identiteto.
Molekulska masa in fragmentacija.
Težke kovine na ravni ppb.
Mikrobiološka varnost po USP.